PCR扩增失败有相当一部分是由于扩增区域存在严重的二级结构（如GC丰富区）所致。在PCR反应体系中加入1/5的PCR优化剂可解决这一难题，并能显著提高PCR反应的产量和特异性。PCR优化剂对DNA测序的“难读区”也有着明显的改善作用。